Прошу поделиться пониманием следующего вопроса,а именно наличе QUE после подлежащего
Не совсем корректно акцентировать внимание на месте вопросительного слова QUE, поскольку суть не в этом. Почему автор приведённого вами вопроса (Les élèves que répondent-ils à leur professeur?) сформулировал его именно так, а вовсе не одним из тех стандартных способов, что вы ожидали:
я ожидал Que répondent les élèves à leur professeur?..
Если бы это была сложная инверсия,то естественно ожидать Que les élèves répondent-ils à leur professeur? ...
Постановка подлежащего (Les élèves) на необычное для него место в самом начале вопросительного предложения с повторением этого подлежащего внутри предложения в виде безударного личного местоимения (ils) - это
приём логического выделения данного члена предложения.
Я занимаюсь по учебнику Казаковой и этот момент не освещен.
Вообще-то там должен быть раздел "Логическое выделение членов предложения"; возможно, правда, что авторы учебника ограничились только повествовательными предложениями, и это несколько сбивает с толку..